Forum
Aktif konular
Üyeler
Kurallar
Arama
R Programlama Dili Ve SPSS R Programlama Dili Ve SPSS
-
4 kredilik matlab gosterdiler bir isime yaramadi, biyologuz diyoruz baska seyler ogret diyoruz hoca tuttu bize bir tusa bastigimizda tus hareket edicekmiste her yon degistirdiginde renk degistirecekmisti ayni zamanda buyuyup kuculucekmis, yok efendim bir proram yazicaz masa ustundeki exel dosyasini secicez sonra programda AHMET aradigimizda bize ozelliklerini vericek mis felanmis hep boylee seyler ogretti. 4 islem haricinde hic bir matematige dair islem yapamiyorum matlab de ama yinede CC ile gecebildik.
Neyse konumuz su ben genetik okuyorum binlerce bazlik dizilimlerimiz oluyo bunlarada nokta mutasyonu ya da bazi aminoasitler felan ariyoruz veya bazen elimizde protein oluyor bunun mutasyonunun proteinde ne gibi farklililara yol acdigini ogrenmemiz gerekiyor ve bu bioinformatik le yapilabilen bir sey.Bu alanda bir cok porgramlama dili kullaniliyor ancak R programing epey is kolaylastirici bir yani var.Simdi ben R programing ve SPSS ogrenmeyi kafaya koydum sorum ise bunlar da ne kadar zorlanirim ve programla ogrenirken Sadece informatik icin isime yarayan kismini mi ogreneyim yoksa temelden mi giris yapayim bu programlamalara?
SPSS de zaten cok bir sey yok gibi bir kac test kullanmayi ogrensem benim isimi gorur cok karmasik hesaplamalari ustasina birakiriz ama dersenizki yok R i en temelden ogren o zaman spss e de ihtiyac kalmaz spss e ugrasmam ve konuya genel olarak tavsiyeleriniz.
Not:destege yazmak gerekde burayada not dusiyim ben pm atamiyorum surekli host yok diye sayfa dusuyo ama forumda dolasirken dolasiyorum pmlerine cevap veremedigim arkadaslar kusurabakmasinlar
-
Hocam sende gördüğüm tipik üniversite öğrencisi psikolojisi.
Hocamız bize öğretmedi, bize yanlış şeyler öğrettiler muhabbetlerinden bir tane daha sadece.
Excel dosyasındaki Ahmet yazısını daha bulamazken, bazik dizilimdeki nokta mutasyonunu nasıl bulacaksın?
Programlamaya başlarken öğrenmen gereken temel şeyler hocanın öğrettikleri.
4 işlemi yapabiliyorsan, geriye birşey kalmıyor zaten algoritma ve programlamanın temelini öğrenmeye başlamışsın demektir.
Yok yapamıyorsan zaten diğerlerini de yapamayacaksın.
Ha diğer konularla ilgili bilgim ve uzmanlığım yok, illaki birisi cevaplar.
-
renegadealien bunu yazdı
Hocam sende gördüğüm tipik üniversite öğrencisi psikolojisi.
Hocamız bize öğretmedi, bize yanlış şeyler öğrettiler muhabbetlerinden bir tane daha sadece.
Excel dosyasındaki Ahmet yazısını daha bulamazken, bazik dizilimdeki nokta mutasyonunu nasıl bulacaksın?
Programlamaya başlarken öğrenmen gereken temel şeyler hocanın öğrettikleri.
4 işlemi yapabiliyorsan, geriye birşey kalmıyor zaten algoritma ve programlamanın temelini öğrenmeye başlamışsın demektir.
Yok yapamıyorsan zaten diğerlerini de yapamayacaksın.
Ha diğer konularla ilgili bilgim ve uzmanlığım yok, illaki birisi cevaplar.
Aslinda ben oyle bahane bulup surekli sikayet eden birisi degilim ve ogrencilerin sikayetlerini toplayip bu sikayetleri cozen birisi olarak zaten bu tutum yapici olmaz.
Benim orada anlatmak stedigim su, Biz Muhendislik fakultesindeyiz bilgisayar muhleri ve diger muhendislerle ayni aldigimiz bazi dersler vardi Matlab de bunlardan birisi Matlab de yapilamiyacak hic birsey yok onu gordum ancak hoca bilgisayar muhendisligi hocasi oldugu icin ve sinifin buyuk bir cogunluguda muhendislik ogrencisi oldugundan matlab de guide kismindan cikamadik ve matematige dair bile birsey goremedik ayni lisede gordugumuz Visual B de yapilan seyleri yaptirdi hani o kadar ders saati o kadar caba bosa gitti cv me dahi yazmiyorum matlabi smdi birsey sorarlar da bilemezsem diye ve dersden de basarisiz gecmedim.
Bu sene n oldu biz konseyde gerekli duzenlemeyi yapip senatoya yolladik artik genetik ve biyomuh ogrencileri dersi ayrica aliyorlar ve ne ogreniyorlar dersin? dna ve aminoasit dizilimi. Yani en basinda olmasi gereken buydu ancak biz yapamadik. Simdi elime bi a4 alip 500 bazlik dizilimde kagitin ustunde stop kodon,mutasyon,promoter bolgelerini ariyorum niye cunku bionformatic bilmiyorum
-
renegadealien bunu yazdı
Hocam sende gördüğüm tipik üniversite öğrencisi psikolojisi.
Hocamız bize öğretmedi, bize yanlış şeyler öğrettiler muhabbetlerinden bir tane daha sadece.
Excel dosyasındaki Ahmet yazısını daha bulamazken, bazik dizilimdeki nokta mutasyonunu nasıl bulacaksın?
Programlamaya başlarken öğrenmen gereken temel şeyler hocanın öğrettikleri.
4 işlemi yapabiliyorsan, geriye birşey kalmıyor zaten algoritma ve programlamanın temelini öğrenmeye başlamışsın demektir.
Yok yapamıyorsan zaten diğerlerini de yapamayacaksın.
Ha diğer konularla ilgili bilgim ve uzmanlığım yok, illaki birisi cevaplar.
Hocam bu konuda yanlışın var.
Matlab dediğin arayüz geliştirilip program yazmak üzerine kullanılan bir program değil, adı üstünde matrix laboratory :)
Adamlar da biyoinformatik üzerine çalışınca muhtemelen büyük datalar ile uğraşıyorlar, temel matris işlemleri toplu veri işleme csvden okuma csvye yazma, ne bileyim PCA nasıl yapılır? Makine öğrenmesi kütphaneleri nasıl kullanılır. Veri nasıl görselleştirilir vb'nin anlatılması lazım. Kaldı ki piyasadaki kullanımının %90'ı bu şekilde zaten :)
Sorunun cevabına gelirsek. Daha önceleri aktif olarak Matlab kullanmış ve Makine Öğrenmesi dersinde ucundan ucundan R'a bulaşmış birisi olarak bence Matlab üzerinden devam etmende fayda var. R zaten Matlab'a benziyor, sadece matlab'ın istatistik ve makine öğrenmesine indirgenmiş hali gibi. R'da yapıp da Matlab'da yapamayacağın birşey olduğunu sanmıyorum. Ayrıca kaynak açısından matlab çok daha geniş ve google da "how reduce data with r" gibi bir arama genelde sağlam sonuç vermiyor :)
SPSS nedir ne değildir hiçbir fikrim yok o yüzden yorum yapamıyorum.
-
Bende matlab anti patisi olan biriyim. Her modülü paralı amkduklarım. Akademik öyle bir kabul etmiş ki, sanki matlab hariç biçbir bokla yapılmaz bu işler. He işleri kolaylaştırıyor mu? Kesinlikle.
Geçen araştırdıydım R programlama dilini, ücretsiz açık kaynak güzel bir dil. Veri madenciliği, makine öğrenmesi, istatistik gibi alanlarda kullanılıyor. Bi arada onada el atacam bakalım.
bioinformatik le restriction enzyme mapper yapmıştım en basitinden bioinf. dersinde. Bana kalırsa bir python felanda öğrenmelisin sadece R ile kalma.
DrKill tarafından 15/Kas/15 21:04 tarihinde düzenlenmiştir -
Hocam bana göre SPSS genetikçiler için iyi bir tercih değil. İşine yaramayacak çok fazla özelliği var ve örneğin primer dizayn analizi gibi yaşamsal konularda da yetersiz kalıyor. Bence onu tam ayrıntı öğrenmeye kasmak gereksiz vakit harcamak olur. SPSSde yapacağın şeyler zaten anova manova fischer vesaire, onları da Minitab ile Wolfram ile bile yapabiliyorsun.
Matlab, R, bunlarla ilgili fikir söylemek için tam olarak ne çalıştığını ve hangi alanda ilerlemeyi düşündüğünü bilmek lazım.
Onun dışında biyologsan nasıl mühendislik fakültesindesin?
izzmarit tarafından 15/Kas/15 21:56 tarihinde düzenlenmiştir -
program yazmadan, çözüm üretmeden programlama dili mi öğrenilir?
hoca 1 veriyorsa sen 10 yazacaksın
python'un modifiye Şahin'i
matlab niyetine kullanabilirsin
ayrıca matlab'da help diye bir komut var, fonksiyonun detaylı açıklaması ve bir örnek sunan, bilmem bilir misin
ek olarak Yardım menüsüne girdiğinde köpek gibi dökümantasyonu var
1 dönemde hocanın ne öğretmesini bekliyorsun ki?
matlab dersini 85 ile geçtim, sorsan matlab biliyor musun, bilmiyorum
niye, üzerine düşmedim, cazip gelmedi
-
@izzmarit
muhendislik ve dogabilimleri fakultesi diye geciyo bizim fakulte ama tabi bildigin gibi bizim muhendis oldugumuz felan yok duz mbg ogrencisiyiz.
Spss gozume basit geldigi icin ogrenmek istiyorum zaten yani spss den kastim seninde yazdigin testler olacak, olurda hayvan deneyleri ya da insanlarda bi polimorfizm bakicak oldugumuzda anlamlimi degilmi,programdan bir rakam alabilelim yeter diye istiyorum,aslinda hic spss e bulasmadan exelde halletsem daha iyi de spss de hazir tusu felanda varken
ben matlab a bulasmak istemiyorum aslinda, cunku bioinformatikde ugrasicak arkadaslarin cogu R ogrenmisler hani ben bu alanda da ilerlemiycem ancak yinede bilgisayarlada aram iyiyken bir ucundan tutayim diyorum ne yapiliyor ne yapilabilir bir goreyim bir kisminida kendim yapayim diye giriyorum. O yuzden anova dir student t k2 testi gibi bir kac test yapabilecek kadar spss, informatikte isime yarayacak kadar da R ogrensem yeter diyorum,senin onun haricinde tavsiye edebilecegin program var mi? gerci bioinformatik de pek program kullanilmiyo gibi hep siteler uzerinden ilerliyolar oralar yetiyo.bi MEGA var bir de geneious var gordugum cok kullanilan.
Bir biyolog olarak tavsiyelerin onemli
@Drkill
Kusurabakma konuda da derinlemesine niyetimi aciklamamisim, program tavsiyen icin ayrica tesekkurler ancak tam olarak bioinformatik de ilerlemek istemedigim icin birde daha iyi bildiginiz gibi programlama okadar kolay olmadigi icin pek bulasmak istemiyorum niyetim temel seyler ogrenmek. SPSS de Belli basli bana P degeri verebilecek testler ve bioinformatikde kullanabilecegim kadar R yeterli olur gibi.
Yani bi aminoasit dizilimi yapip 3d goruntusunu olusturup ayni proteinin mutantinin 3d goruntusunu olsuturup ust uste bindirip ne degisiyo bakabilsem ya da hangi bolgede hangi harf eklendiginde ne gibi degisiklikler oluyo gibi seyler bilsem bana yeticek dahasi zaten derya deniz ben baska bir alanda calismak istiyorumda
-
Hocam Minitab'a bi bakar misin? Dedigin analizleri guzelce yapan minik bir programcik bu. Kullanimi da asiri kolay. Ayrica portable da kullanabilir cok lazim olursa matlaba spsse export da edebilirsin. Bu ufaklik senin isini gorecek gibi.
Spsse Ra harcayacagin vakti de bana sorarsan ncbi vb. siteleri/sistemleri (blast, refseq..) ogrenmeye harca. Yarin bir liste yaparim isine yarar gorduklerine bakinirsin.
Onun disinda, protein modelleme mi calisiyorsun?
izzmarit tarafından 16/Kas/15 00:33 tarihinde düzenlenmiştir
Kısayol
Şikayet
Özel Mesaj
Alıntı yap
Cevapla