Forum
Aktif konular
Üyeler
Kurallar
Arama
Ölümsüzlük Mümkün Müdür? Ölümsüzlük Mümkün Müdür?
-
Ölümsüzlük bulunsa dahi halkın haberi olmaz ve halk bu teknolojiden yararlanamaz.
GusFring tarafından 29/Tem/13 22:44 tarihinde düzenlenmiştir -
KrypT bunu yazdıTugberk bunu yazdı
FireX'in sitesinde güzel bir yazı var bu konuda, bilimsel olarak ilgilenenler okusun.
http://www.bilimsehri.com/makaleler/telomer.html
Tam okumadım göz gezdirdim ama gözüme çarpan bir hata var. Meşguliyetim geçince yazayım, Firex hala TBT'yi takip ediyorsa düzeltsin. Böyle paylaşımlar yapmasını takdir ettim doğrusu, bu site hakkında bilgim yoktu. Gerçi Firex'i hep takdir ederdim zaten hahah.
"DNA replikasyonu sırasında kayıplar gerçekleşebilmektedir ve kısalmalar olur. Bu kısalmalar sırasında normalde işe yaramayan tekrar yapıları, yani telomerler kısalır ve bu sayede kullanılan DNA kodu korunmuş olur. Böylece genetik bilgi kaybedilmez."
Bu cümle yanlış bilgi veriyor. DNA replikasyonu sırasında kayıplar şans eseri gerçekleşmekte veya gerçekleşmemekte diye bir durum yok. DNA replikasyonu sırasında kayıp her zaman gerçekleşir (istisnalar dışında). Bunun sebebi "End Replication Problem" dediğimiz replikasyonun sonlandırılması problemidir. Bazları birbirine eşleyip replikat DNA'yı oluşturan enzim olan DNA Polimeraz sadece 3' -> 5' yönünde çalışır. Biyoloji dersinden hatırladığımız gibi DNA birbirini tamamlayan iki iplikten oluşmaktadır ve bu iplikler birbirine ters uzanır;
5'----------------------------------------------3'
3'----------------------------------------------5'DNA polimeraz 3' -> 5' yönünde çalışır dedik (bunların ne olduğu artık temel biyolojisi bilgisi diye girmiyorum). Yani DNA polimeraz sadece varolan serbest 3' hidroksil grubuna bağlanıp ipliği buradan uzatabilir. Şimdi DNA replike edilirken, helikaz enzimi ile helixi açtık iki ipliği birbirinden ayırdık.
5'-----------------------
\ -----------------------3'
/ -----------------------5'
3'-----------------------Alttaki iplikte zaten serbest bir 3' hidroksil grubu olacağından DNA polimeraz buradan sorunsuz bir şekilde yeni DNA'yı oluşturabilir bu yüzden buradan oluşturulan ipliğe "leading strand" diyoruz. Problem şurda ki; üstteki iplikte serbest 3' hidroksil grubu yok. Bu yüzden iplğie önce küçük bir RNA primer eklenir. Daha sonra DNA polimeraz bu primerin serbest hidroksil grubuna bağlanarak yeni ipliği uzatır, taaki bir önceki eklenen primere gelene kadar. Bu işlem helikaz DNA'yı açtıkça tekrarlanır. Bu yüzden üstteki iplik fragmentler yani parçalar halinde kopyalanır ki buna Okazaki fragmentleri diyoruz. Daha sonra bu RNA primerleri DNA ile değiştiriyor bla bla detayına girmiyorum (gerçi detay dediğim de olayın yüzde 1'i falan). Böyle bir sürü işlem olduğu için üstteki iplik DNA replikasyonu sırasında gecikir, daha yavaş kopyalanır. Bu yüzden buradan oluşturulan ipliğe ise "lagging strand" diyoruz.
Esas sorunumuz helix tamamen açılıp lagging strand'in sonuna geldiğimizde ortaya çıkıyor. RNA primerleri DNA ile değiştiriliyor dedik. Yani şöyle hayal edin lagging strand'i;
5'--------------------------------------------------------3'
-----------------------------------------------------Az üsttte duran çizgiler RNA primerlerimiz olsun. Bunları ordan aldık;
5'--------------------------------------------------------3'
-------------- ---------------- -----------
3' 3'RNA primerleri aldığımızda gördüğünüz gibi iplikte boş kalan yerlerin DNA ile doldurulabilmesini mümkün kılan boşta 3' hidroksil grupları olur. Ancak, en son RNA primer, ipliğin en ucuna bağlansa bile (ki genellikle daha geriye bağlanır) o RNA primer çıkarıldığında onun yerine DNA sentezleyebilmek için gerekli boşta 3' hidroksil grubu bulunmamakta. Bu yüzden, her DNA replikasyonunda, lagging strand'in 5' ucunda baz kaybı yaşanır ki işte telomer dediğimiz kısım bu kısım oluyor. Telomeraz ile kaybedilen telomerin yenilenmesini de anlatırdım ama yeter dshfshdfç. Tabi bunun yanında oksidatif stres sonucu telomer kaybı yaşanıyor, zaten telomerlerin amacı DNA'yı korumak, eğer telomerler olmasa DNA'nın bilgi içeren kısmı oksidatif strese maruz kalırdı.
Takıldığım bir diğer nokta ise "Telomerin kısalması demek DNA’nın etkinliğinin azalması demektir. Onarım faaliyetinin düşmesi kanser riskini arttırır. " cümlesi. Bunun kaynağı nedir?
Böyle makaleler yazarken sadece kaynakça vermek yerine, yazı içerisinde kaynakçaya atıf yapılırsa herkes için daha uygun olacaktır. -
KrypT bunu yazdıKrypT bunu yazdıTugberk bunu yazdı
FireX'in sitesinde güzel bir yazı var bu konuda, bilimsel olarak ilgilenenler okusun.
http://www.bilimsehri.com/makaleler/telomer.html
Tam okumadım göz gezdirdim ama gözüme çarpan bir hata var. Meşguliyetim geçince yazayım, Firex hala TBT'yi takip ediyorsa düzeltsin. Böyle paylaşımlar yapmasını takdir ettim doğrusu, bu site hakkında bilgim yoktu. Gerçi Firex'i hep takdir ederdim zaten hahah.
"DNA replikasyonu sırasında kayıplar gerçekleşebilmektedir ve kısalmalar olur. Bu kısalmalar sırasında normalde işe yaramayan tekrar yapıları, yani telomerler kısalır ve bu sayede kullanılan DNA kodu korunmuş olur. Böylece genetik bilgi kaybedilmez."
Bu cümle yanlış bilgi veriyor. DNA replikasyonu sırasında kayıplar şans eseri gerçekleşmekte veya gerçekleşmemekte diye bir durum yok. DNA replikasyonu sırasında kayıp her zaman gerçekleşir (istisnalar dışında). Bunun sebebi "End Replication Problem" dediğimiz replikasyonun sonlandırılması problemidir. Bazları birbirine eşleyip replikat DNA'yı oluşturan enzim olan DNA Polimeraz sadece 3' -> 5' yönünde çalışır. Biyoloji dersinden hatırladığımız gibi DNA birbirini tamamlayan iki iplikten oluşmaktadır ve bu iplikler birbirine ters uzanır;
5'----------------------------------------------3'
3'----------------------------------------------5'DNA polimeraz 3' -> 5' yönünde çalışır dedik (bunların ne olduğu artık temel biyolojisi bilgisi diye girmiyorum). Yani DNA polimeraz sadece varolan serbest 3' hidroksil grubuna bağlanıp ipliği buradan uzatabilir. Şimdi DNA replike edilirken, helikaz enzimi ile helixi açtık iki ipliği birbirinden ayırdık.
5'-----------------------
\ -----------------------3'
/ -----------------------5'
3'-----------------------Alttaki iplikte zaten serbest bir 3' hidroksil grubu olacağından DNA polimeraz buradan sorunsuz bir şekilde yeni DNA'yı oluşturabilir bu yüzden buradan oluşturulan ipliğe "leading strand" diyoruz. Problem şurda ki; üstteki iplikte serbest 3' hidroksil grubu yok. Bu yüzden iplğie önce küçük bir RNA primer eklenir. Daha sonra DNA polimeraz bu primerin serbest hidroksil grubuna bağlanarak yeni ipliği uzatır, taaki bir önceki eklenen primere gelene kadar. Bu işlem helikaz DNA'yı açtıkça tekrarlanır. Bu yüzden üstteki iplik fragmentler yani parçalar halinde kopyalanır ki buna Okazaki fragmentleri diyoruz. Daha sonra bu RNA primerleri DNA ile değiştiriyor bla bla detayına girmiyorum (gerçi detay dediğim de olayın yüzde 1'i falan). Böyle bir sürü işlem olduğu için üstteki iplik DNA replikasyonu sırasında gecikir, daha yavaş kopyalanır. Bu yüzden buradan oluşturulan ipliğe ise "lagging strand" diyoruz.
Esas sorunumuz helix tamamen açılıp lagging strand'in sonuna geldiğimizde ortaya çıkıyor. RNA primerleri DNA ile değiştiriliyor dedik. Yani şöyle hayal edin lagging strand'i;
5'--------------------------------------------------------3'
-----------------------------------------------------Az üsttte duran çizgiler RNA primerlerimiz olsun. Bunları ordan aldık;
5'--------------------------------------------------------3'
-------------- ---------------- -----------
3' 3'RNA primerleri aldığımızda gördüğünüz gibi iplikte boş kalan yerlerin DNA ile doldurulabilmesini mümkün kılan boşta 3' hidroksil grupları olur. Ancak, en son RNA primer, ipliğin en ucuna bağlansa bile (ki genellikle daha geriye bağlanır) o RNA primer çıkarıldığında onun yerine DNA sentezleyebilmek için gerekli boşta 3' hidroksil grubu bulunmamakta. Bu yüzden, her DNA replikasyonunda, lagging strand'in 5' ucunda baz kaybı yaşanır ki işte telomer dediğimiz kısım bu kısım oluyor. Telomeraz ile kaybedilen telomerin yenilenmesini de anlatırdım ama yeter dshfshdfç. Tabi bunun yanında oksidatif stres sonucu telomer kaybı yaşanıyor, zaten telomerlerin amacı DNA'yı korumak, eğer telomerler olmasa DNA'nın bilgi içeren kısmı oksidatif strese maruz kalırdı.
Takıldığım bir diğer nokta ise "Telomerin kısalması demek DNA’nın etkinliğinin azalması demektir. Onarım faaliyetinin düşmesi kanser riskini arttırır. " cümlesi. Bunun kaynağı nedir?
Böyle makaleler yazarken sadece kaynakça vermek yerine, yazı içerisinde kaynakçaya atıf yapılırsa herkes için daha uygun olacaktır."DNA replikasyonu sırasında kayıplar gerçekleşebilmektedir ve kısalmalar olur. Bu kısalmalar sırasında normalde işe yaramayan tekrar yapıları, yani telomerler kısalır ve bu sayede kullanılan DNA kodu korunmuş olur. Böylece genetik bilgi kaybedilmez."
"Kayıplar gerçekleşebilmektedir" kısmını yazarken aklımdan olasılıklara dayanan bir durum geçmedi. Kimi durumlarda kısalmanın olduğunu, kimi durumlarda olmadığını kastetseydim devamında "kısalmalar olur" yazmak yerine "kısalmalar olabilir" derdim. Ancak devamında görüldüğü üzere kesin ve net ifadeler kullandım. "Gerçekleşebilmektedir" kısmını yazarken "gerçekleşir"şeklinde aktarmaktan istisnalar dahil bilinen ve bilinmeyen tüm durumları kapsayacak düzeyde kesin bir ifade kullanmamak adına o an kaçınmış olmalıyım. Telomerlerin hücre bölünmesiyle kısaldığı ve bölünmenin limitini belirlediği zaten açık olduğundan ve yazıda ağırlıklı olarak bahsedildiğinden dolayı gözüme çarpmadı, buna takılınacağını düşünmedim. Ancak burada söylediğin türde bir anlam çıkabildiğinden dolayı yazıda bahsi geçen bölümü "gerçekleşir" şeklinde düzenledim.
"Telomerin kısalması demek DNA’nın etkinliğinin azalması demektir. " kısmı Matt Ridley'in genom kitabından bir parça. Telomerin DNA'nın onarılması konusundaki önemi ve kansere yol açacak bozuklukların düzeltilememesi, olayı genel bir ifadeye sürüklüyor. Ancak pek tabii ki burada geçen durum kısalmanın ve onarılma konusundaki başarısızlığın birbirine karşı dengede olduğu bir durum. Zira bilindiği üzere kanserli hücreler telomeraz sayesinde telomerleri yenileyip çok hızlı bir şekilde çoğalıyorlar.
anonim6918524 tarafından 30/Tem/13 01:00 tarihinde düzenlenmiştir -
FireX bunu yazdı"DNA replikasyonu sırasında kayıplar gerçekleşebilmektedir ve kısalmalar olur. Bu kısalmalar sırasında normalde işe yaramayan tekrar yapıları, yani telomerler kısalır ve bu sayede kullanılan DNA kodu korunmuş olur. Böylece genetik bilgi kaybedilmez."
"Kayıplar gerçekleşebilmektedir" kısmını yazarken aklımdan olasılıklara dayanan bir durum geçmedi. Kimi durumlarda kısalmanın olduğunu, kimi durumlarda olmadığını kastetseydim devamında "kısalmalar olur" yazmak yerine "kısalmalar olabilir" derdim. Ancak devamında görüldüğü üzere kesin ve net ifadeler kullandım. "Gerçekleşebilmektedir" kısmını yazarken "gerçekleşir"şeklinde aktarmaktan istisnalar dahil bilinen ve bilinmeyen tüm durumları kapsayacak düzeyde kesin bir ifade kullanmamak adına o an kaçınmış olmalıyım. Telomerlerin hücre bölünmesiyle kısaldığı ve bölünmenin limitini belirlediği zaten açık olduğundan ve yazıda ağırlıklı olarak bahsedildiğinden dolayı gözüme çarpmadı, buna takılınacağını düşünmedim. Ancak burada söylediğin türde bir anlam çıkabildiğinden dolayı yazıda bahsi geçen bölümü "gerçekleşir" şeklinde düzenledim.
"Telomerin kısalması demek DNA’nın etkinliğinin azalması demektir. " kısmı Matt Ridley'in genom kitabından bir parça. Telomerin DNA'nın onarılması konusundaki önemi ve kansere yol açacak bozuklukların düzeltilememesi, olayı genel bir ifadeye sürüklüyor. Ancak pek tabii ki burada geçen durum kısalmanın ve onarılma konusundaki başarısızlığın birbirine karşı dengede olduğu bir durum. Zira bilindiği üzere kanserli hücreler telomeraz sayesinde telomerleri yenileyip çok hızlı bir şekilde çoğalıyorlar.
Artık okulda yazdığımız makalelerin, tez gerekçelerinin, tezlerin hocalarımız ve jüriler tarafından kelime kelime, hatta hece hece, hatta ve hatta harf harf irdelenmesi bana da bulaşmış demek ki takıldım kelimeye.
'"Telomerin kısalması demek DNA’nın etkinliğinin azalması demektir. " kısmı Matt Ridley'in genom kitabından bir parça.' Buna bakmak gerekecek, aklıma yatmadı.Başka bir problem yok ama şunu soracağım "onarılma konusundaki başarısızlık" derken replikasyondan kaynaklanan DNA degredasyonunu mu kastediyorsun?
Bu arada, senin gibi bilen ve bildiğini anlatabilen birini burada tekrar görebilmek güzel.
krypt tarafından 30/Tem/13 01:24 tarihinde düzenlenmiştir -
fiziksel ölümsüzlüğü sçsalar bulamazlar ama manevi ölümsüzlükmü istiyon al sana mevlana en basit örneği ....
-
Değildir
-
KrypT bunu yazdıFireX bunu yazdı
*doğru bilgi*
Artık okulda yazdığımız makalelerin, tez gerekçelerinin, tezlerin hocalarımız ve jüriler tarafından kelime kelime, hatta hece hece, hatta ve hatta harf harf irdelenmesi bana da bulaşmış demek ki takıldım kelimeye.
'"Telomerin kısalması demek DNA’nın etkinliğinin azalması demektir. " kısmı Matt Ridley'in genom kitabından bir parça.' Buna bakmak gerekecek, aklıma yatmadı.Başka bir problem yok ama şunu soracağım "onarılma konusundaki başarısızlık" derken replikasyondan kaynaklanan DNA degredasyonunu mu kastediyorsun?
Bu arada, senin gibi bilen ve bildiğini anlatabilen birini burada tekrar görebilmek güzel.
Bilgi doğru, proofreading yapılırken çıkan bir sorun sözkonusu. Tam düzelmiyordu hatalar fakat ayrıntısını tam hatırlayamadım, DNA Pol II elongationda sapıttığı için proofreader exonucleaselar bir noktada havada kalıp işini tamamlayamıyor muydu, öyle bir şeydi. Bakar yazarım akşama.
FireX, hocam ben sana yetişememiştim, buralarda görmek güzel.
-
izzmarit bunu yazdıKrypT bunu yazdıFireX bunu yazdı
*doğru bilgi*
Artık okulda yazdığımız makalelerin, tez gerekçelerinin, tezlerin hocalarımız ve jüriler tarafından kelime kelime, hatta hece hece, hatta ve hatta harf harf irdelenmesi bana da bulaşmış demek ki takıldım kelimeye.
'"Telomerin kısalması demek DNA’nın etkinliğinin azalması demektir. " kısmı Matt Ridley'in genom kitabından bir parça.' Buna bakmak gerekecek, aklıma yatmadı.Başka bir problem yok ama şunu soracağım "onarılma konusundaki başarısızlık" derken replikasyondan kaynaklanan DNA degredasyonunu mu kastediyorsun?
Bu arada, senin gibi bilen ve bildiğini anlatabilen birini burada tekrar görebilmek güzel.
Bilgi doğru, proofreading yapılırken çıkan bir sorun sözkonusu. Tam düzelmiyordu hatalar fakat ayrıntısını tam hatırlayamadım, DNA Pol II elongationda sapıttığı için proofreader exonucleaselar bir noktada havada kalıp işini tamamlayamıyor muydu, öyle bir şeydi. Bakar yazarım akşama.
FireX, hocam ben sana yetişememiştim, buralarda görmek güzel.
Böyle bir şeyi hiç duymadım. Böyle bir şey olsa hücre hayflick limitine ulaşmadan şu an gözlemlediğimizden daha çok mutasyon gözlemleyebilmemiz gerekmez miydi?
-
-
husnuweb bunu yazdı
binlerce yıl yaşamayı sağlayacak teknolojik gelişmeler olabilir; ama bence ölümsüzlük mümkün değil.
Kısayol
Şikayet
Özel Mesaj
Alıntı yap
Cevapla